Olá pessoal,
Infelizmente tive muitos problemas nas ultimas atualizações no NodeJS e do NPM, com diversos problemas de cache e erros. A única forma que encontrei foi a remoção completa do NodeJS e do NPM, e sua re-instalação.
Devido a essas dificuldades, resolvi compartilhar o passo a passo para remoção completa do NodeJS e do NPM para que uma nova instalação funcione normalmente.
Para ser sincero, não sei ao certo se os problemas que eu enfrentei são comuns, mas de qualquer forma, se alguém estiver tendo esse tipo de problema, sugiro seguir os passos abaixo e ai sim, instalar a versão 5.0.
- sudo rm -rf /usr/local/lib/node
- sudo rm -rf /usr/local/lib/node_modules
- sudo rm -rf /usr/local/include/node
- sudo rm -rf /usr/local/include/node_modules
- sudo rm -rf /usr/local/bin/node
- sudo rm -rf /usr/local/bin/npm
- sudo rm -rf /usr/local/bin/node.d
- sudo rm -rf /usr/local/lib/dtrace/node.d
- sudo rm -rf /usr/local/share/man/man1/node.1
- sudo rm -rf ~/node
- sudo rm -rf ~/node_modules
- sudo rm -rf ~/.npm
- sudo rm -rf ~/.node-gyp
Depois disso, fiz a instalação normal pelo PKG disponível no site do NodeJS e o download de dependências normalizou.

Detalhe, tentei por várias vezes limpar o cache do NPM mas mesmo assim não obtive sucesso, essa foi a única forma encontrada. Caso conheça outra forma, por favor, comente abaixo!
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